일반 대학원은 해당하는 전공에 대하여 학부 과정을 두고 있으며, 따라서 학부 과정의 연장선상에 있다고 볼 수 있습니다. 특수 대학원은 일반적으로 직장인을 대상으로 하여 직장에서의 자신의 업무 분야와 관련된 학위를 받을 수 있도록 개설된 과정이며, 강의는 야간에 이루어집니다.
전문 대학원의 경우는 학부 과정을 두고 있지 않으며 모든 강의는 주간에 이루어집니다. 또한 이론과 실무를 같은 비중으로 겸비한 전문가를 육성하고자 개설된 과정입니다.
현재 연세대학교에는 전문대학원으로 국제학대학원, 정보대학원, 커뮤니케이션대학원, 사회복지대학원, 연합신학대학원, 경영전문대학원, 법학전문대학원이 있으며, 특수대학원으로 교육대학원, 행정대학원, 공학대학원, 보건대학원, 언론홍보대학원, 법무대학원, 생활환경대학원, 경제대학원, 간호대학원, 보건환경대학원(원주), 정경ㆍ창업대학원(원주), 교육대학원(원주) 등이 있습니다.